Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK4Q16654 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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