Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYPL1Q16563 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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