Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GABRA6Q16445 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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