Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms