Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR1D2Q14995 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms