Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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CHD4Q14839 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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CHD4Q14839 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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CHD4Q14839 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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