Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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