Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSHL1Q14406 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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