Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL4A6Q14031 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL4A6Q14031 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL4A6Q14031 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL4A6Q14031 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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