Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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GTF2H3Q13889 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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GTF2H3Q13889 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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