Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms