Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms