Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms