Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms