Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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KCNMA1Q12791 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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