Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms