Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms