Protein–RNA interactions for Protein: P98153

DGCR2, Integral membrane protein DGCR2/IDD, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR2P98153 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DGCR2P98153 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DGCR2P98153 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DGCR2P98153 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DGCR2P98153 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DGCR2P98153 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DGCR2P98153 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DGCR2P98153 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms