Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX6P78412 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.2 ms