Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms