Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-24P63145 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms