Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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