Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms