Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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