Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORCP51449 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORCP51449 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms