Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IQGAP1P46940 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IQGAP1P46940 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms