Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms