Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJC1P36383 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJC1P36383 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJC1P36383 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms