Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HOXD3P31249 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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HOXD3P31249 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HOXD3P31249 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HOXD3P31249 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD3P31249 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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