Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms