Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU1F1P28069 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms