Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX1P27695 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX1P27695 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX1P27695 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX1P27695 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX1P27695 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX1P27695 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX1P27695 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX1P27695 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX1P27695 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX1P27695 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX1P27695 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX1P27695 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX1P27695 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX1P27695 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX1P27695 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms