Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3BP20337 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms