Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFP17480 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBTFP17480 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBTFP17480 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBTFP17480 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBTFP17480 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBTFP17480 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBTFP17480 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBTFP17480 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBTFP17480 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms