Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOLR1P15328 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms