Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms