Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ODC1P11926 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ODC1P11926 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODC1P11926 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODC1P11926 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODC1P11926 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms