Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms