Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPLNO95428 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms