Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms