Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPLO60437 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPLO60437 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPLO60437 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPLO60437 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPLO60437 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPLO60437 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPLO60437 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPLO60437 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPLO60437 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPLO60437 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms