Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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