Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms