Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms