Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms