Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF13Q9Y2Y9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF13Q9Y2Y9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms