Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEFF2Q9UIK5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms