Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNAJB11Q9UBS4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms