Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms