Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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